阿合马很快提出了方案：在南京、卫辉（今天河南的卫辉）等路按户籍收集药材；在蔡州发售十二万斤官盐，禁止人们私相贸易。
忽必烈认为切实可行。
阿合马为人足智多谋，又会说话。大家都称赞阿合马十分能干。大汗忽必烈也格外器重他。
忽必烈急于建设富强的国家，又见阿合马才气逼人，因此放手让他大胆办事，对他的建议也无不采纳。
久而久之，阿合马成为一人之下、万人之上的权臣，因而开始专权、更加刚愎自用了。
右丞相安童看到阿合马长期专权，心里很不舒服，便上奏忽必烈说：“大都路总管阿合马之子忽辛手下的人大多不称职。阿合马和张惠把持宰相的大权，做商贾之事，尽收天下之利，受害的百姓有苦无处诉。”
阿合马得知以后争辩道：“是谁胡说这样的话？我与张惠要与他当廷辩论。”
安童又对忽必烈说道：“忽辛的部下在官府与商人的木材交易中谋取私利，罪状清楚。”
忽必烈说道：“若是这样，查明后撤了他的职。”
安童接着告发了忽辛与一桩泄密案有牵连。
忽必烈责备安童道：“他对自己的部下与胡人做生意的事尚且不知道，怎能把国家的机密交给他呢？”
后来，中书左丞崔斌奏告忽必烈：“杭州地大，责任不轻。阿合马以自己的不肖之子抹速忽担任达鲁花赤、佩虎符，岂是量才授官之道？以前，阿合马自己要求免除子弟的职务，他现在自己身居平章要职，全家的族人都安置在要害部门。这样是自背前言有损公道啊。”
忽必烈看到对阿合马的举报越来越多，思想上有些动摇了，于是下令罢免了阿合马许多子弟的职务，但是没有处理阿合马本人。
忽必烈曾经对淮西宣慰使昂吉儿说过：“做宰相的人要明天道、察地理、尽人事。兼有此三条的才是称职的宰相。阿里海牙、麦丁等也不能当宰相。回回人中只有阿合马才可以担任宰相。”
可见，忽必烈是多么信任阿合马啊。
阿合马长期身居高位，自然地形成了自己的小圈子，实行的政策又触动了权贵的利益，惹怒了朝廷内外的很多人。
安童在容忍了很久之后才向忽必烈汇报说：“我近来常说尚书省、枢密院、御史台宜于各自遵循常例向皇帝作报告，重大问题应该由侍从的大臣议定后上奏，这是皇帝已有旨应允了的。现在一切由阿合马的尚书省报告，似乎违背了皇帝以前应允了的话。”
忽必烈说道：“你说得很对，我哪里想到阿合马因为得到我的充分信任而敢于如此呢？有些问题我没有和你商议是不对的。应该像你说的那样，三家各按常制奏事为好。”
安童趁机揭发道：“阿合马所用的部官很多都不称职。但是，阿合马已经得到大汗的同意宣布了。应当在他们上任后多加考核，看其是否真能胜任。上任的时间长了，个人的品行和才能是可以看出来的。”
忽必烈点头称是。
阿里和阿合马、赛典赤因为同是花剌子模的回回人，有过一些面上的来往。努海成为大元的主将以后，与阿合马来往较多，也曾劝阻他注意保护自己，以免惹怒众人。
阿合马正值春风得意，并没有听进去努海的忠告。
1282年的4月，忽必烈前往上都，太子真金一起陪同。
益都（今天的山东省青州）的千户王著平常疾恶如仇，知道很多人愤恨阿合马，便秘密地铸造了一把大铜锤，发誓要用铜锤砸死阿合马。
恰好这时，有个姓高的妖僧和尚在军中行秘术。
王著便与他们合谋，诈称阴历3月18日太子要回来做佛事，纠结了80多人趁着夜色潜入了大都城。
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