战云密布的紧急关头，他上书当时的张佩伦等大臣，提出战守之策，均不得呈达。开战前一天，将平日所用香纂寄归其母。表示以身许国决心。开战时，法舰凭借优势火力，突袭扬武等舰，福建水师各舰在不利条件下，以劣势装备奋勇作战，拼死抵抗。他驾建胜舰，迎着敌舰密集炮火，冲锋陷阵，发炮攻击敌舰。终因舰小势孤，武备落后，被敌舰连续击中而沉没，若是按历史，此时他已身亡了，也不知是吴辰来到这个世界的缘故还是其他，这个林森林倒是幸运，落水之后被人救起。
南洋水师覆灭，当时朝廷大为震动，于是便开始秋后算账，张佩纶、何如璋这些人统统拿办，林森林运气不好，因他的建胜舰沉没，大部分官兵死亡，唯独他还活着，这还了得，摆明了是临阵脱逃了的啊，当时拿办的钦差不理会林森林的抗辩之词，将其革职拿办，后头还加了个永不叙用，算是彻彻底底的让林森林下了岗，林森林痛定思痛，便在福建沿海做了个火轮船长，做了几年的清闲日子，后来同期同班的同学林履中在朝鲜谋到了朝鲜水师提督的差使，林履中似乎还没有忘记这位远在福建的落难兄弟，写信相召，林森林便兴冲冲的来了。
有了林履中的推荐，再加上船政学堂有林森林一份档案证明他在学习期间成绩倒是拔尖，还有人证明海战之时，这位林森林确实没有临阵脱逃，非但如此，反而是建胜舰冲在最前，吴辰倒是让船政学堂、水师、西洋教练三方对他进行了评估考核，结果顺利通过，吴辰拍着他的肩，语重心长的说了一句话，林森林现在还记得。
“林老哥人才难得，能来投效吴某人，吴某人感激涕零，朝鲜新组建了警备舰队，这舰队的司令非你莫属了。”
林森林开始一愣，想不到这朝鲜人才匮乏到这种地步，自个儿出来乍到，就成了司令，自然是一番感恩戴德，兴冲冲的跑去上任，到了港口，他这个司令便被海关的司长叫了去，司长年纪不大，恐怕也只是在大学堂刚毕业几年的，朝鲜不是人才匮乏吗，这官都低龄化了，也是没办法的事。结果这位司长负着手，对林森林好一通言语，最后说：“近来西北海域步太平，有不少船主声言那里出没了水匪，你出来乍到，就先紧要着多分派些兵轮到那里去巡逻，务必要保证海路畅通，嗯，今日就说到这里，你若是有什么请求，可以直接来找我，我既是你的上司，同时也是你的晚辈，没有这么多虚礼的。”
林森林这才知道，所谓的司令在这朝鲜似乎不太值钱，只能叹息自个儿时运不济了。值得他心里舒坦了点的是，新一批分配到警备舰队的朝鲜船政学堂毕业生之中，有一个人却成了他的下属——吴保初。
正牌子的吴辰胞弟，现在在给他林森林打下手，不管怎么说，他这个司令再不值钱，吴保初是他的下属，按这推理，应当是比他更不值钱吧，想到这个，林森林心里头就舒坦了，今个儿他布置各管带的巡防路线，亲自上了兵轮，在航线上等着那些即将驶入仁川港的商船，等候多时，总算来了一艘。(！)