种司令部（除战略火箭部队外）主要是和平时期的军事行政工作，而十三个大军区才是平时训练、考核及战时指挥具有真正实权的作战指挥部门。需要说明的是，由于龙军战略火箭部队和国土防空与航天部队的作战任务特殊，他们的指挥权全部集中在军种司令部手中。因此，军区和五个战略集群的司令部在战争时期只能直接指挥陆军、海军和空军的相应部队，各军区司令部要在取得更高一级授权（皇帝亲自批准）后，才能指挥战术核武器部队和战区性国土防空部队。

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